青苔：主要生长在水族箱玻璃或缸中石块表面上绿色的膜片状藻类。这种青苔可以使用像小精灵、黑线飞狐、白玉飞狐等鱼类进行清除。黑毛藻：大部分丛生于水草叶缘。当发现鱼缸繁殖这类的藻类时，应该立即利用剪刀把长藻的叶片直接剪掉，以尽可能把它从水族缸彻底移除。或者使用专业的除藻剂来进行清除。
马尾松叶法：每亩鱼池用新鲜马尾松叶20公斤浸泡后，磨碎加水成浆汁25公斤，泼洒全池，每天一次，连续使用2天～3天即可见效。
鱼缸爆藻，添加藻类的天敌，食藻类的鱼儿来控制藻类是十分有效的。比如黑线狐狸喜欢吃须状藻，幼鱼吃藻类的效果很明显。清苔鼠、金苔鼠会不断在植物的叶子，茎和根上刮藻食用。还有黑球和黑玛丽也喜欢吃食叶子的苔藓，但他们的食物不是以苔藓为主。另外还有黑壳虾、大和藻虾。
樱花虾、黑壳虾这两种便宜的工具虾即可，按你的缸大小放一些下去，除藻效果很好，尤其对丝藻类清除效果极佳。小精灵鱼、黑线飞狐除藻效果也还不错，尤其对绿斑藻、黑毛藻效果较好，但是清除较长的丝藻力有不逮。
刮藻刀则是省时省力的首选，如果没有，硬卡片也能临时替代，但需注意操作方便性。光照对水藻的生长有很大影响，避免阳光直射鱼缸，以减少水生植物的过度代谢。在控制灯光时，应遵循适度原则，避免过强或过长的光照，一般草缸的照明时间应保持在10小时左右。
水藻的作用：生长在水里的藻类植物，是最简单的水生植物，它含有叶绿素。是水中的隐内花植物，同陆地上的植物一容样，氮、磷、钾是它们生长所需的基本元素。能放出氧气，就是水中的绿色植物。这些对生长在水中的鱼呼吸氧气更有益处。
